在微波加工系统中，常用的材料有导体、绝缘体、介质、极性和磁性化合物几类。

1）导体

一定厚度以上的导体，如铜、银铝之类的金属，能够饭盒微波，因此在微波系统中，常利用导体反射微波的这种特殊形式来传播微波能量。例如，微波装置能够常用的波导管，就是矩形或圆形的金属管，通常由铝或黄铜制成。它们像光纤传导光线一样，是微波的通路。

2）绝缘体

在微波系统中，绝缘体有其完全不同于普通电路中的地位。绝缘体可透过微波，并且它吸收的微波功率很小。微波与绝缘体间的相互作用，就像光线和玻璃的关系一样，玻璃使光线部分地反射，但大部分则透过，只有很少部分被吸收。在微波系统中，根据不同情况使用玻璃、陶瓷、聚四氟乙烯、聚丙烯之类的绝缘体，它们常作为反应器的材料。由于这种“透明”特性，在微波工程中也常用绝缘体材料来防止污物进入某些要害部位，这时的绝缘体就成为有效的屏障。

3）介质

对微波而言，介质具有吸收、穿透和反射的性能。介质通常就是被加工的物料，它们不同程度地吸收微波的能量，这类物料也称为有耗介质。特别是含污水和含脂肪的物料，它们不同程度地吸收微波能量并将其转变为热量。

4）极性和磁性化合物

这类材料的一般性能非常像介质材料，也反射、吸收和穿透微波。应当指出，由于微波能量具有能对介质材料和有极性、磁性的材料产生影响的电场和磁场，因此许多极性化合物、磁性材料同介质材料一样，也易于作微波加工材料。